V Národnom centre NMR sú združené tieto inštitúcie:
- Fakulta chemickej a potravinárskej technológie Slovenskej technickej univerzity
- Prírodovedecká fakulta Univerzity Pavla Jozefa Šafárika
- Prírodovedecká fakulta Univerzity Komenského
- Farmaceutická fakulta Univerzity Komenského
- Jesseniova lekárska fakulta Univerzity Komenského
- Chemický ústav Slovenskej akadémie vied
- Fakulta elektrotechniky a informatiky Technickej univerzity v Košiciach
- Ústav merania Slovenskej akadémie vied
Na pokrytie čo najširšieho spektra úloh riešiteľných pomocou NMR sa v rámci NC NMR vytvorili centrá poskytujúce služby s dôrazom na nasledujúce oblasti:
- Centrum pre metabolické štúdie a kontrolu potravín
- Centrum pre štúdium štruktúry, dynamiky a interakcií biomolekúl
- Centrum pre štúdium štruktúry, dynamiky a interakcií organických molekúl
- Centrum pre supramolekulovú chémiu a nanotechnológie
- Centrum pre NMR spektroskopiu v tuhej fáze
- Centrum pre NMR materiálové zobrazovanie